Povodeň vznikla v důsledku vydatných a přívalových srážek na konci června. Během povodně byly na území ORP Vodňany zaplaveny obce Bavorov, Krašlovice, Vodňany a místní části, v Bavorově zaplaven hlavní zdroj pitné vody pro zásobování města, voda byla dovážena cisternami do vodojemu. Přívalové srážky zasáhly a způsobily škody také v obcích Hájek, Bílsko, Budyně, Křtětice, Libějovice - Nestanice, Krajníčko, Kloub – Pohorovice, Pivkovice – Chrást, Čičenice. V průběhu povodně nebyla průjezdná silnice II. tř. č. 142 v úseku Bavorov - Netolice z důvodu zaplavení vozovky.
Přímo ve Vodňanech bylo zaplaveno 46 rodinných domů a 124 rekreačních objektů. Podrobné informace o průběhu povodně jsou uvedeny v příloze dPP.
Mapa zaplaveného území města Vodňany v červnu 2009
Letecká fotka zaplaveného území města Vodňany v červnu 2009
Manipulace na nádrži Husinec během povodně v červnu 2009
Průtoky na řece Blanici v profilu Heřmaň během povodně v červnu 2009