Území ORP je charakteristické polohou na obou březích řeky Vltavy, severní část území města pak i na březích řeky Lužnice. V jižní části ORP se nachází VD Hněvkovice, která je součástí Vltavské kaskády. Soutok obou významných a vodnatých toků vytvářejících hluboká údolí, dva větší přítoky Lužnice – levostranná Smutná a pravostranná Židova strouha, a několik jejich drobných přítoků charakterizují i význam řešení problematiky protipovodňové ochrany města. Údolí obou významných vodních toků jsou zalesněná a nacházejí se v nich chatové osady, velká část území města nad údolními nivami je poměrně plochá a bezlesá a využívaná v zemědělství, osídlení je spíše rozptýlené. Sklonitost některých svahů v kombinaci se zemědělským obhospodařováním je riziková z hlediska přívalových srážek, jak je vidět i v části charakterizující jednotlivé obce v ORP
